לאחר סיום לימודיה במינכן ובפריס השתלמה מרטינה סילבסטר בנגינה בחליל ברוק, בהיסטוריה של הביצוע ובאילתור. כנגנית בתזמורת, ניגנה בשורות תזמורות מובילות ברחבי אירופה תחת שרביטם של מלחינים ידועים כגון סר קולין דייויס, קשישטף פנדרצקי, פרידריך היידר, שלמה מינץ, פאבל קליניצ'ב, מרקוס פושנר ואריאל צוקרמן. כסולנית הופיעה עם תזמורות קאמריות, ביניהן תזמורת באך ממינכן, שעימה הופיעה לראשונה ביפן ב-2017. ב-2009 הקימה ביחד עם הפסנתרנית סוזנה קלובסקי את אנסמבל קלאזיק: הרכב הכולל חליל, פסנתר, קונטרבאס וכלי נקישה, המשלב ג'אז עם מוסיקה קלאסית. מ-2014 היא מופיעה עם הנבלאית פאודורה יוהנה מנדל כצמד "נאייאד". היא מופיעה בקביעות בישראל בשיתוף פעולה עם המלחין אורי ברנר ובגרמניה עם הפסנתרנית מאשה דימיטרייבה. מרטינה סילבסטר חברה בקרן "מוסיקה חיה עכשיו!" ע"ש יהודי מנוחין ומקליטה לטלוויזיה, לרדיו ולתקליטורים. היא מלמדת ומנחה כיתות אמן. היא מנגנת על חליל זהב 14 קראט מתוצרת מאיאזווה.